木材防腐剂的使用要针对合适的对象（木材或人造板或工程木），在适当的时机（发生腐朽变质之前）进行处理，选用有效的防腐剂产品，使用恰当的浓度，采用恰当的处理方法，使木材达到正确的药剂保持量，防腐处理木制品的使用环境是正确的（正确的应用）。

需要提醒的是，天然耐久木材之所以具有一定的耐腐性或抗蚁性，是因为在其心材中存在一些毒性成分，在木材学中称之为木材“抽提物”。由于毒性成分的存在，这些天然耐久木材的锯末、锯粉等也可引起一些过敏体质人群出现皮疹、呼吸困难和其他健康问题。当这些锯末形成的粉尘浓度较高时，或室内通风不良时，尤其如此。这一点，与防腐木材一样。因此在加工天然耐久木材时，要采取与加工同样的人员防护措施。

硼砂是一种毒性极低的木材防腐剂，甚至公认为无毒的木材防腐剂。硼砂也是制造药皂、玻璃、陶瓷等的原料，对皮肤病有一定的医治效果，而硼元素也存在于人体中，但硼是人体限量元素，人体若摄入过多的硼砂，会引起各脏器的蓄积中毒，硼砂在进入胃部之后会刺激胃酸分泌，严重的会刺激人的胃部出现恶心、呕吐、腹泻等症状，因此硼砂也不能无限制地应用。

国际上通行的对木材进行防腐处理的主要方法是：采用一种不宜溶解的水性防腐剂，在密闭的真空罐内对木材施压的同时，将防腐剂打入木材纤维。经过压力处理后的木材，稳定性更强，防腐剂可以有效地防止霉菌、白蚁和昆虫对木材的侵害。从而使经过处理的木材具有在户外恶劣环境下长期使用的卓越的防腐性能。